Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD53P19397 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CD53P19397 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CD53P19397 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CD53P19397 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CD53P19397 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CD53P19397 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CD53P19397 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CD53P19397 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD53P19397 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD53P19397 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CD53P19397 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD53P19397 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD53P19397 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD53P19397 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD53P19397 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD53P19397 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD53P19397 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD53P19397 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD53P19397 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD53P19397 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD53P19397 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CD53P19397 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD53P19397 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD53P19397 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD53P19397 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD53P19397 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD53P19397 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD53P19397 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CD53P19397 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CD53P19397 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD53P19397 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CD53P19397 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD53P19397 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD53P19397 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD53P19397 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD53P19397 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD53P19397 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD53P19397 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD53P19397 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD53P19397 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD53P19397 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD53P19397 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CD53P19397 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD53P19397 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD53P19397 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD53P19397 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD53P19397 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD53P19397 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD53P19397 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD53P19397 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD53P19397 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD53P19397 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD53P19397 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD53P19397 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD53P19397 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD53P19397 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD53P19397 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD53P19397 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD53P19397 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CD53P19397 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD53P19397 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD53P19397 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD53P19397 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD53P19397 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD53P19397 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD53P19397 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD53P19397 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD53P19397 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD53P19397 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD53P19397 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD53P19397 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD53P19397 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD53P19397 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD53P19397 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD53P19397 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CD53P19397 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD53P19397 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD53P19397 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD53P19397 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD53P19397 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD53P19397 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD53P19397 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD53P19397 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD53P19397 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD53P19397 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD53P19397 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD53P19397 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD53P19397 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD53P19397 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD53P19397 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CD53P19397 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD53P19397 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD53P19397 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD53P19397 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD53P19397 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD53P19397 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD53P19397 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD53P19397 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD53P19397 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms