Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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