Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTPS1P17812 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms