Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC130P13994 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms