Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DMDP11532 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DMDP11532 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DMDP11532 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DMDP11532 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DMDP11532 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DMDP11532 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DMDP11532 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
DMDP11532 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DMDP11532 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DMDP11532 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DMDP11532 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DMDP11532 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DMDP11532 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
DMDP11532 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
DMDP11532 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DMDP11532 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
DMDP11532 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DMDP11532 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DMDP11532 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DMDP11532 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DMDP11532 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DMDP11532 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DMDP11532 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DMDP11532 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DMDP11532 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DMDP11532 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DMDP11532 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DMDP11532 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DMDP11532 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DMDP11532 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DMDP11532 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DMDP11532 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DMDP11532 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DMDP11532 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DMDP11532 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DMDP11532 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DMDP11532 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DMDP11532 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DMDP11532 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DMDP11532 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DMDP11532 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DMDP11532 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DMDP11532 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DMDP11532 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DMDP11532 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DMDP11532 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DMDP11532 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DMDP11532 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DMDP11532 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DMDP11532 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DMDP11532 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DMDP11532 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DMDP11532 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DMDP11532 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DMDP11532 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DMDP11532 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DMDP11532 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DMDP11532 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DMDP11532 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DMDP11532 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DMDP11532 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DMDP11532 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DMDP11532 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DMDP11532 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DMDP11532 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DMDP11532 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DMDP11532 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DMDP11532 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DMDP11532 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DMDP11532 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DMDP11532 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DMDP11532 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DMDP11532 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DMDP11532 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DMDP11532 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DMDP11532 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DMDP11532 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DMDP11532 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DMDP11532 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DMDP11532 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DMDP11532 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DMDP11532 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DMDP11532 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DMDP11532 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DMDP11532 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DMDP11532 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DMDP11532 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DMDP11532 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DMDP11532 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DMDP11532 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DMDP11532 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DMDP11532 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DMDP11532 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DMDP11532 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DMDP11532 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DMDP11532 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DMDP11532 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DMDP11532 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DMDP11532 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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