Protein–RNA interactions for Protein: P10720

PF4V1, Platelet factor 4 variant, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4V1P10720 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PF4V1P10720 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PF4V1P10720 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PF4V1P10720 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PF4V1P10720 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PF4V1P10720 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PF4V1P10720 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PF4V1P10720 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PF4V1P10720 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PF4V1P10720 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PF4V1P10720 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PF4V1P10720 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PF4V1P10720 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PF4V1P10720 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PF4V1P10720 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PF4V1P10720 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PF4V1P10720 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PF4V1P10720 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PF4V1P10720 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PF4V1P10720 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PF4V1P10720 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PF4V1P10720 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PF4V1P10720 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PF4V1P10720 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PF4V1P10720 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PF4V1P10720 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PF4V1P10720 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PF4V1P10720 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PF4V1P10720 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PF4V1P10720 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PF4V1P10720 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PF4V1P10720 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PF4V1P10720 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PF4V1P10720 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PF4V1P10720 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PF4V1P10720 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PF4V1P10720 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PF4V1P10720 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PF4V1P10720 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PF4V1P10720 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PF4V1P10720 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PF4V1P10720 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PF4V1P10720 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PF4V1P10720 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PF4V1P10720 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PF4V1P10720 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PF4V1P10720 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PF4V1P10720 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PF4V1P10720 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PF4V1P10720 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PF4V1P10720 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PF4V1P10720 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PF4V1P10720 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PF4V1P10720 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PF4V1P10720 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PF4V1P10720 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PF4V1P10720 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PF4V1P10720 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PF4V1P10720 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PF4V1P10720 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PF4V1P10720 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PF4V1P10720 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PF4V1P10720 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PF4V1P10720 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PF4V1P10720 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PF4V1P10720 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PF4V1P10720 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PF4V1P10720 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PF4V1P10720 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PF4V1P10720 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PF4V1P10720 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PF4V1P10720 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PF4V1P10720 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PF4V1P10720 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PF4V1P10720 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PF4V1P10720 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PF4V1P10720 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PF4V1P10720 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PF4V1P10720 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PF4V1P10720 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PF4V1P10720 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PF4V1P10720 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PF4V1P10720 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PF4V1P10720 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PF4V1P10720 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PF4V1P10720 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PF4V1P10720 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PF4V1P10720 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PF4V1P10720 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PF4V1P10720 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PF4V1P10720 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PF4V1P10720 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PF4V1P10720 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PF4V1P10720 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PF4V1P10720 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PF4V1P10720 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PF4V1P10720 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PF4V1P10720 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PF4V1P10720 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PF4V1P10720 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms