Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHGAP10645 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHGAP10645 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHGAP10645 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CHGAP10645 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHGAP10645 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CHGAP10645 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHGAP10645 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHGAP10645 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHGAP10645 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHGAP10645 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHGAP10645 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHGAP10645 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHGAP10645 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHGAP10645 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHGAP10645 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHGAP10645 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHGAP10645 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHGAP10645 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHGAP10645 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHGAP10645 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHGAP10645 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHGAP10645 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHGAP10645 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHGAP10645 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHGAP10645 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHGAP10645 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHGAP10645 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CHGAP10645 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHGAP10645 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHGAP10645 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHGAP10645 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHGAP10645 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHGAP10645 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHGAP10645 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHGAP10645 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHGAP10645 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHGAP10645 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHGAP10645 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHGAP10645 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHGAP10645 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHGAP10645 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHGAP10645 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHGAP10645 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHGAP10645 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHGAP10645 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHGAP10645 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHGAP10645 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHGAP10645 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHGAP10645 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CHGAP10645 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHGAP10645 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHGAP10645 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHGAP10645 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHGAP10645 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHGAP10645 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CHGAP10645 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHGAP10645 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHGAP10645 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHGAP10645 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHGAP10645 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHGAP10645 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHGAP10645 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHGAP10645 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHGAP10645 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHGAP10645 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHGAP10645 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHGAP10645 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHGAP10645 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHGAP10645 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHGAP10645 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHGAP10645 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHGAP10645 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CHGAP10645 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHGAP10645 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHGAP10645 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHGAP10645 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHGAP10645 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHGAP10645 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHGAP10645 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHGAP10645 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHGAP10645 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHGAP10645 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHGAP10645 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHGAP10645 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CHGAP10645 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHGAP10645 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHGAP10645 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHGAP10645 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHGAP10645 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHGAP10645 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHGAP10645 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHGAP10645 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHGAP10645 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHGAP10645 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHGAP10645 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHGAP10645 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHGAP10645 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHGAP10645 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHGAP10645 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms