Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GLI3P10071 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GLI3P10071 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GLI3P10071 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GLI3P10071 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GLI3P10071 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GLI3P10071 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GLI3P10071 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GLI3P10071 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GLI3P10071 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GLI3P10071 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GLI3P10071 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GLI3P10071 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GLI3P10071 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GLI3P10071 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GLI3P10071 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GLI3P10071 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GLI3P10071 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GLI3P10071 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GLI3P10071 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GLI3P10071 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GLI3P10071 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GLI3P10071 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GLI3P10071 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GLI3P10071 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GLI3P10071 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GLI3P10071 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GLI3P10071 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GLI3P10071 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GLI3P10071 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GLI3P10071 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GLI3P10071 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GLI3P10071 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GLI3P10071 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GLI3P10071 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GLI3P10071 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GLI3P10071 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GLI3P10071 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GLI3P10071 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GLI3P10071 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GLI3P10071 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GLI3P10071 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GLI3P10071 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GLI3P10071 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GLI3P10071 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GLI3P10071 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GLI3P10071 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GLI3P10071 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GLI3P10071 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GLI3P10071 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GLI3P10071 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GLI3P10071 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GLI3P10071 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GLI3P10071 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GLI3P10071 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GLI3P10071 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GLI3P10071 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GLI3P10071 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GLI3P10071 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GLI3P10071 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GLI3P10071 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GLI3P10071 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GLI3P10071 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GLI3P10071 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GLI3P10071 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GLI3P10071 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GLI3P10071 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GLI3P10071 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GLI3P10071 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GLI3P10071 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GLI3P10071 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GLI3P10071 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GLI3P10071 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GLI3P10071 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GLI3P10071 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GLI3P10071 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GLI3P10071 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GLI3P10071 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GLI3P10071 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GLI3P10071 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GLI3P10071 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GLI3P10071 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GLI3P10071 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GLI3P10071 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GLI3P10071 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GLI3P10071 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GLI3P10071 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GLI3P10071 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GLI3P10071 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GLI3P10071 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GLI3P10071 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GLI3P10071 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GLI3P10071 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GLI3P10071 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GLI3P10071 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GLI3P10071 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GLI3P10071 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GLI3P10071 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GLI3P10071 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GLI3P10071 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms