Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRCP08575 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms