Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSF1RP07333 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF1RP07333 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms