Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOL3O95236 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOL3O95236 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOL3O95236 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOL3O95236 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOL3O95236 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOL3O95236 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOL3O95236 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOL3O95236 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOL3O95236 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOL3O95236 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOL3O95236 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOL3O95236 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOL3O95236 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOL3O95236 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOL3O95236 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOL3O95236 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOL3O95236 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APOL3O95236 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOL3O95236 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOL3O95236 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOL3O95236 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOL3O95236 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOL3O95236 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APOL3O95236 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOL3O95236 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOL3O95236 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOL3O95236 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOL3O95236 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APOL3O95236 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOL3O95236 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APOL3O95236 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOL3O95236 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APOL3O95236 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOL3O95236 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOL3O95236 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APOL3O95236 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APOL3O95236 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOL3O95236 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOL3O95236 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOL3O95236 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOL3O95236 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOL3O95236 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOL3O95236 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOL3O95236 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOL3O95236 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOL3O95236 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOL3O95236 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOL3O95236 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOL3O95236 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOL3O95236 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOL3O95236 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOL3O95236 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOL3O95236 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOL3O95236 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOL3O95236 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOL3O95236 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOL3O95236 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOL3O95236 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOL3O95236 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOL3O95236 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
APOL3O95236 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOL3O95236 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOL3O95236 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOL3O95236 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOL3O95236 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOL3O95236 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOL3O95236 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOL3O95236 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOL3O95236 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOL3O95236 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOL3O95236 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOL3O95236 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOL3O95236 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOL3O95236 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
APOL3O95236 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
APOL3O95236 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOL3O95236 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOL3O95236 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOL3O95236 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOL3O95236 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOL3O95236 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOL3O95236 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOL3O95236 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOL3O95236 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOL3O95236 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
APOL3O95236 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOL3O95236 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOL3O95236 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOL3O95236 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOL3O95236 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOL3O95236 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOL3O95236 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOL3O95236 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOL3O95236 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOL3O95236 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOL3O95236 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOL3O95236 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOL3O95236 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOL3O95236 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms