Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PPFIA4O75335 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms