Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA2O43921 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms