Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNMO15061 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNMO15061 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNMO15061 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNMO15061 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNMO15061 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNMO15061 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNMO15061 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNMO15061 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNMO15061 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNMO15061 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNMO15061 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNMO15061 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNMO15061 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNMO15061 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNMO15061 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNMO15061 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNMO15061 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYNMO15061 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYNMO15061 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYNMO15061 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYNMO15061 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYNMO15061 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYNMO15061 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYNMO15061 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYNMO15061 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYNMO15061 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYNMO15061 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYNMO15061 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYNMO15061 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYNMO15061 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYNMO15061 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYNMO15061 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
SYNMO15061 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYNMO15061 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYNMO15061 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYNMO15061 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYNMO15061 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNMO15061 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNMO15061 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNMO15061 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNMO15061 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNMO15061 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNMO15061 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNMO15061 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNMO15061 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNMO15061 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNMO15061 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYNMO15061 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNMO15061 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNMO15061 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNMO15061 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNMO15061 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNMO15061 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNMO15061 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNMO15061 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNMO15061 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNMO15061 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNMO15061 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNMO15061 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYNMO15061 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNMO15061 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNMO15061 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNMO15061 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNMO15061 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNMO15061 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNMO15061 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNMO15061 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNMO15061 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNMO15061 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNMO15061 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNMO15061 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNMO15061 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNMO15061 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNMO15061 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNMO15061 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNMO15061 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNMO15061 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNMO15061 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNMO15061 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYNMO15061 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNMO15061 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNMO15061 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNMO15061 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNMO15061 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNMO15061 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNMO15061 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNMO15061 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNMO15061 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNMO15061 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNMO15061 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNMO15061 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNMO15061 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNMO15061 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNMO15061 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNMO15061 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNMO15061 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNMO15061 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNMO15061 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYNMO15061 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms