Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFIT3O14879 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFIT3O14879 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms