Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP2O14595 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms