Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRTO14522 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
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