Protein–RNA interactions for Protein: H3BNL8

C6orf229, Uncharacterized protein C6orf229, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf229H3BNL8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C6orf229H3BNL8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms