Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SOBPA7XYQ1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SOBPA7XYQ1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms