Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 HYDIN-206ENST00000393567 15719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 DTHD1-201ENST00000357504 3203 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RUNX1T1-201ENST00000265814 7284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLASP2-225ENST00000635664 4176 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAVS-202ENST00000428216 11714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 MON2-202ENST00000393630 13275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHIP-201ENST00000275034 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPN14-201ENST00000366956 12985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 HTT-201ENST00000355072 13474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC4A10-201ENST00000272716 3414 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 NCKAP1-202ENST00000361354 20347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms