Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
FOXD1Q16676 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
FOXD1Q16676 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
FOXD1Q16676 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
FOXD1Q16676 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
FOXD1Q16676 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
FOXD1Q16676 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
FOXD1Q16676 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
FOXD1Q16676 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
FOXD1Q16676 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
FOXD1Q16676 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
FOXD1Q16676 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
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FOXD1Q16676 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
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FOXD1Q16676 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
FOXD1Q16676 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
FOXD1Q16676 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
FOXD1Q16676 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
FOXD1Q16676 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
FOXD1Q16676 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
FOXD1Q16676 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
FOXD1Q16676 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
FOXD1Q16676 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
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FOXD1Q16676 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
FOXD1Q16676 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
FOXD1Q16676 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
FOXD1Q16676 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
FOXD1Q16676 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
FOXD1Q16676 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
FOXD1Q16676 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
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FOXD1Q16676 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
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FOXD1Q16676 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
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FOXD1Q16676 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
FOXD1Q16676 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
FOXD1Q16676 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
FOXD1Q16676 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
FOXD1Q16676 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
FOXD1Q16676 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
FOXD1Q16676 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
FOXD1Q16676 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
FOXD1Q16676 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
FOXD1Q16676 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
FOXD1Q16676 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
FOXD1Q16676 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
FOXD1Q16676 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
FOXD1Q16676 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
FOXD1Q16676 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
FOXD1Q16676 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
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