Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PKN1Q16512 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 214.7 ms