Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
SYCP1Q15431 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SYCP1Q15431 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.6 ms