Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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NFIAQ12857 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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