Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ9

KRTAP4-8, Keratin-associated protein 4-8, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-8Q9BYQ9 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 APOL4-212ENST00000616056 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 OPALIN-203ENST00000393871 3545 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZNF445-202ENST00000425708 10052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 LINC01814-202ENST00000454224 8839 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 MYPN-201ENST00000354393 4596 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 PIK3R3-202ENST00000372006 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZNF716-201ENST00000420713 5197 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL008638.3-201ENST00000623027 5182 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 HEPH-209ENST00000519389 6013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZNF385D-201ENST00000281523 10699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 DSCAM-203ENST00000617870 6176 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 ITPR1-203ENST00000357086 9762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 DEFA11P-201ENST00000446470 261 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC026461.2-201ENST00000568608 244 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 KIAA1143-201ENST00000296121 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 UTY-213ENST00000612274 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 HIVEP2-202ENST00000367603 9724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 DSG3-201ENST00000257189 5525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL359263.1-201ENST00000441188 2796 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC092111.1-201ENST00000618256 3358 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC007993.1-201ENST00000621298 2430 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AMOT-201ENST00000304758 6888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 KLF7-202ENST00000412414 7954 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 NUP98-202ENST00000355260 5628 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 OR5AU1-202ENST00000641039 8232 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-8Q9BYQ9 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.8 ms