Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
MSMPQ1L6U9 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.9 ms