Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC1.12□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
IMPG1Q17R60 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.1□□□□□ -2.23
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