Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
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FOXD1Q16676 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
FOXD1Q16676 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
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