Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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NKX1-1Q15270 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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NKX1-1Q15270 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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NKX1-1Q15270 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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NKX1-1Q15270 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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NKX1-1Q15270 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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NKX1-1Q15270 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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NKX1-1Q15270 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NKX1-1Q15270 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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