Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
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