Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXE3Q13461 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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