Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRHP20396 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRHP20396 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRHP20396 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRHP20396 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRHP20396 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRHP20396 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRHP20396 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRHP20396 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRHP20396 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRHP20396 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRHP20396 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRHP20396 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRHP20396 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRHP20396 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRHP20396 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRHP20396 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRHP20396 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRHP20396 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRHP20396 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRHP20396 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRHP20396 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRHP20396 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRHP20396 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRHP20396 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRHP20396 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRHP20396 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRHP20396 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRHP20396 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRHP20396 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRHP20396 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRHP20396 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRHP20396 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRHP20396 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRHP20396 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRHP20396 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRHP20396 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRHP20396 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRHP20396 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRHP20396 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRHP20396 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRHP20396 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TRHP20396 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TRHP20396 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TRHP20396 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TRHP20396 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TRHP20396 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TRHP20396 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TRHP20396 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRHP20396 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRHP20396 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRHP20396 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRHP20396 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRHP20396 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRHP20396 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRHP20396 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TRHP20396 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRHP20396 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRHP20396 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRHP20396 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRHP20396 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRHP20396 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRHP20396 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRHP20396 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRHP20396 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRHP20396 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRHP20396 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRHP20396 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRHP20396 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TRHP20396 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRHP20396 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRHP20396 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TRHP20396 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRHP20396 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRHP20396 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRHP20396 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRHP20396 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRHP20396 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRHP20396 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRHP20396 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRHP20396 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRHP20396 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRHP20396 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRHP20396 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRHP20396 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRHP20396 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRHP20396 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRHP20396 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRHP20396 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRHP20396 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRHP20396 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TRHP20396 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRHP20396 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TRHP20396 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
TRHP20396 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
TRHP20396 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
TRHP20396 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
TRHP20396 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
TRHP20396 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
TRHP20396 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.8 ms