Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
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RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
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