Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PXDC1Q5TGL8 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PXDC1Q5TGL8 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.7 ms