Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPRNQ16849 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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PTPRNQ16849 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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PTPRNQ16849 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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PTPRNQ16849 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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PTPRNQ16849 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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PTPRNQ16849 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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