Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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RPE65Q16518 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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RPE65Q16518 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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RPE65Q16518 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RPE65Q16518 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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