Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
NR1D2Q14995 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1D2Q14995 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1D2Q14995 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1D2Q14995 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1D2Q14995 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1D2Q14995 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1D2Q14995 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1D2Q14995 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1D2Q14995 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1D2Q14995 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1D2Q14995 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1D2Q14995 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1D2Q14995 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1D2Q14995 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1D2Q14995 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1D2Q14995 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1D2Q14995 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1D2Q14995 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1D2Q14995 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1D2Q14995 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1D2Q14995 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1D2Q14995 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1D2Q14995 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1D2Q14995 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1D2Q14995 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1D2Q14995 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.3 ms