Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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SMC1AQ14683 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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SMC1AQ14683 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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SMC1AQ14683 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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SMC1AQ14683 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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SMC1AQ14683 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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SMC1AQ14683 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMC1AQ14683 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SMC1AQ14683 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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