Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GTF2H3Q13889 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 990.6 ms