Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CLN3Q13286 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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