Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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RABGEF1Q9UJ41 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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RABGEF1Q9UJ41 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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RABGEF1Q9UJ41 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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RABGEF1Q9UJ41 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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RABGEF1Q9UJ41 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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RABGEF1Q9UJ41 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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