Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SPOCK3Q9BQ16 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
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