Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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ECM1Q16610 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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ECM1Q16610 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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ECM1Q16610 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ECM1Q16610 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
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