Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBA3CQ13748 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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