Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
PKD2Q13563 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
PKD2Q13563 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PKD2Q13563 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PKD2Q13563 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PKD2Q13563 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PKD2Q13563 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PKD2Q13563 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PKD2Q13563 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PKD2Q13563 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PKD2Q13563 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PKD2Q13563 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PKD2Q13563 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PKD2Q13563 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PKD2Q13563 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PKD2Q13563 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PKD2Q13563 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PKD2Q13563 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PKD2Q13563 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PKD2Q13563 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PKD2Q13563 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PKD2Q13563 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PKD2Q13563 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PKD2Q13563 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PKD2Q13563 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PKD2Q13563 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PKD2Q13563 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PKD2Q13563 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PKD2Q13563 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PKD2Q13563 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PKD2Q13563 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PKD2Q13563 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PKD2Q13563 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PKD2Q13563 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PKD2Q13563 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PKD2Q13563 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PKD2Q13563 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PKD2Q13563 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PKD2Q13563 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PKD2Q13563 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.2 ms