Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 198.9 ms