Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRIM28Q13263 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM28Q13263 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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