Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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TRAF3Q13114 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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TRAF3Q13114 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TRAF3Q13114 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
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TRAF3Q13114 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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TRAF3Q13114 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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TRAF3Q13114 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRAF3Q13114 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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