Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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SMARCB1Q12824 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
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SMARCB1Q12824 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
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SMARCB1Q12824 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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SMARCB1Q12824 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
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SMARCB1Q12824 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMARCB1Q12824 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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