Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1Q9UJ41 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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